中醫芳香療法也已經有悠久的歷史，早在殷商甲骨文中便有熏燎、艾蒸和釀制香酒的記載，至周代就有佩帶香囊、沐浴蘭湯的習俗。自東漢香料傳入后，古人在焚香驅逐蚊蟲，凈化空氣，預防疫病等方面更是有了新的突破，李時珍在《本草綱目》中就有記載，在疫氣大行之時，可在室內用蒼術、艾葉、丁香等藥熏煙，為空氣消毒。
現代形式的芳香療法起源于20世紀20年代，法國化學家Rene—Maurice Gattefosse一次在自己家的香料實驗室里不小心燙了手，在驚慌下立刻從身邊瓶子里倒出薰衣草油涂在手上，他的手很快就痊愈并且沒有傷疤，他認為這是因為薰衣草油的奇特效果，于是對精油的醫療特性非常感興趣，并把這一新領域命名為“芳香療法”。